Tiền thân từ Ban Kiểm Định Và Giám Sát Nội Bộ được thành lập theo quyết định số 368/TĐT-TCNS ngày 29/5/2007 của hiệu trưởng. Ban được thành lập trên cớ sở xác nhập các hoạt động có sẵn của nhà trường, bao gồm thanh tra đào tạo, ban ISO, kiểm định chất lượng, thanh tra nội bộ và pháp chế và chính thức hoạt động từ ngày 1/6/2007. Theo quyết định số 847/TĐT-TCHC ngày 20/08/2009, Ban Kiểm định và Giám sát nội bộ chuyển thành phòng Kiểm định và Giám sát nội bộ kể từ ngày 01/09/2009.